L'assemblée des délégués est l'organe le plus haut de la Fédération suisse de canoë-kayak. Elle décide de toutes les affaires essentielles de la fédération : de l'approbation des comptes annuels et du budget à l'élection du comité directeur, en passant par les modifications des statuts et les orientations stratégiques. Chaque section a le droit de vote - en fonction du nombre de ses membres. L'assemblée des délégués garantit ainsi que la base du sport de pagaie puisse participer directement aux décisions concernant la direction que prend Swiss Canoe.
